2.4 General structural formula of amino acids, peptide bond and formation of dipeptide (অ্যামাইনো অ্যাসিড এর গঠনগত সাধারণ সংকেত, পেপটাইড বন্ড ও ডাইপেপটাইড এর গঠন)

অ্যামিনো অ্যাসিডের সাধারণ রাসায়নিক গঠন সংকেতটি নিচে দেওয়া হলো:

      H
      |
  H₂N - C - COOH
      |
      R

উপাদানসমূহের ব্যাখ্যা:

H₂N: অ্যামিনো গ্রুপ
C: কেন্দ্রীয় কার্বন (α-কার্বন)
COOH: কার্বক্সিল গ্রুপ
H: হাইড্রোজেন পরমাণু
R: পার্শ্ব শৃঙ্খলা বা R-গ্রুপ, যা প্রতিটি অ্যামিনো অ্যাসিডে ভিন্ন হয়

উদাহরণ হিসেবে কিছু সাধারণ অ্যামিনো অ্যাসিডের সংকেত:

গ্লাইসিন (Glycine):

R = H

সংকেত:

    H
    |
H₂N - C - COOH
    |
    H

অ্যালানিন (Alanine):

R = CH₃

সংকেত:

    H
    |
H₂N - C - COOH
    |
   CH₃

সেরিন (Serine):

R = CH₂OH

সংকেত:

    H
    |
H₂N - C - COOH
    |
  CH₂OH

ভ্যালিন (Valine):

R = CH(CH₃)₂

সংকেত:

    H
    |
H₂N - C - COOH
    |
CH(CH₃)₂

এই সাধারণ গঠন সংকেতগুলি অ্যামিনো অ্যাসিডের মূল কাঠামোকে বোঝায় এবং পার্শ্ব শৃঙ্খলা বা R-গ্রুপের পরিবর্তনের মাধ্যমে বিভিন্ন অ্যামিনো অ্যাসিড তৈরি হয়।

পেপটাইড বন্ড:

পেপটাইড বন্ড হলো অ্যামিনো অ্যাসিডের মধ্যে গঠিত একটি বিশেষ ধরনের কেমিক্যাল বন্ড যা দুটি অ্যামিনো অ্যাসিডের সংযোগ স্থাপন করে। এই বন্ডটি একটি অ্যামিনো অ্যাসিডের কার্বক্সিল গ্রুপ (-COOH) এবং অন্য অ্যামিনো অ্যাসিডের অ্যামিনো গ্রুপ (-NH₂) এর মধ্যে কনডেনসেশন প্রতিক্রিয়ার মাধ্যমে গঠিত হয়। এই প্রক্রিয়ায় একটি পানির অণু মুক্ত হয়।

পেপটাইড বন্ড গঠনের প্রক্রিয়া:

প্রথম অ্যামিনো অ্যাসিড: এর কার্বক্সিল গ্রুপ (-COOH)।
দ্বিতীয় অ্যামিনো অ্যাসিড: এর অ্যামিনো গ্রুপ (-NH₂)।
কনডেনসেশন প্রতিক্রিয়া: কার্বক্সিল গ্রুপের একটি হাইড্রোক্সিল গ্রুপ (-OH) এবং অ্যামিনো গ্রুপের একটি হাইড্রোজেন পরমাণু (H) মিলিত হয়ে একটি পানির অণু (H₂O) গঠন করে এবং একটি পেপটাইড বন্ড তৈরি হয়।

পেপটাইড বন্ডের রাসায়নিক সংকেত:

    O    H   H   O
    ||   |   |   ||
- C - N - C - C -
      |       |
      R₁     R₂

উদাহরণ:

গ্লাইসিন এবং অ্যালানিনের মধ্যে পেপটাইড বন্ড গঠনের প্রক্রিয়া:

গ্লাইসিন: H₂N-CH₂-COOH
অ্যালানিন: H₂N-CH(CH₃)-COOH

গ্লাইসিনের কার্বক্সিল গ্রুপ এবং অ্যালানিনের অ্যামিনো গ্রুপের মধ্যে পেপটাইড বন্ড গঠন:

       H       O       H   H
       |       ||      |   |
H₂N - C - C - N - C - C - OH
       |       |      |   |
       H       H     CH₃   H₂O (জল মুক্ত হয়)

এটি সংক্ষেপে দেখায়:

       H       O       H   H
       |       ||      |   |
H₂N - CH₂ - C - N - CH - C - OH + H₂O
                      |
                     CH₃

গঠনের পর প্রোটিন বা পলিপেপটাইডের মূল কাঠামোতে একাধিক অ্যামিনো অ্যাসিড যুক্ত হয়ে দীর্ঘ চেইন তৈরি করে। পেপটাইড বন্ড প্রোটিনের গঠন ও স্থিতিশীলতার জন্য অত্যন্ত গুরুত্বপূর্ণ।

ডাইপেপটাইড এর গঠন:

ডাইপেপটাইড হলো দুটি অ্যামিনো অ্যাসিডের মধ্যে পেপটাইড বন্ড দ্বারা গঠিত যৌগ। ডাইপেপটাইড গঠনের জন্য দুটি অ্যামিনো অ্যাসিডের একটি অ্যামিনো গ্রুপ এবং অন্যটির কার্বক্সিল গ্রুপের মধ্যে কনডেনসেশন প্রতিক্রিয়া ঘটে, যার ফলে একটি পানির অণু (H₂O) মুক্ত হয় এবং একটি পেপটাইড বন্ড গঠিত হয়।

উদাহরণ:

গ্লাইসিন এবং অ্যালানিনের ডাইপেপটাইড গঠন

গ্লাইসিন (Glycine) এর রাসায়নিক গঠন:

H₂N-CH₂-COOH

অ্যালানিন (Alanine) এর রাসায়নিক গঠন:

H₂N-CH(CH₃)-COOH

ডাইপেপটাইড গঠনের প্রক্রিয়া:

গ্লাইসিনের কার্বক্সিল গ্রুপ (-COOH) এবং অ্যালানিনের অ্যামিনো গ্রুপ (-NH₂) কনডেনসেশন প্রতিক্রিয়ায় যুক্ত হয়।
একটি পানির অণু (H₂O) মুক্ত হয়।
একটি পেপটাইড বন্ড গঠিত হয়।

রাসায়নিক প্রক্রিয়া এবং গঠন:

গ্লাইসিন + অ্যালানিন -> গ্লাইসিলঅ্যালানিন + জল

গ্লাইসিন:
```
H₂N-CH₂-COOH
```
অ্যালানিন:
```
H₂N-CH(CH₃)-COOH
```

ডাইপেপটাইড গঠন (গ্লাইসিলঅ্যালানিন):

   H   H       O       H   H
   |   |       ||      |   |
   N - C - C - N - C - C - OH
H₂   |       |       |   |
      H       H      CH₃

আরও সরলীকৃত সংকেত:

H₂N-CH₂-CONH-CH(CH₃)-COOH

এখানে,

প্রথম অ্যামিনো অ্যাসিড (গ্লাইসিন) এর কার্বক্সিল গ্রুপ (-COOH) দ্বিতীয় অ্যামিনো অ্যাসিড (অ্যালানিন) এর অ্যামিনো গ্রুপ (-NH₂) এর সাথে পেপটাইড বন্ড গঠন করে।
মুক্ত হওয়া পানির অণু (H₂O) কনডেনসেশন প্রতিক্রিয়ার ফলাফল।

উপসংহার:

ডাইপেপটাইড গঠনের সময় দুটি অ্যামিনো অ্যাসিড একটি পেপটাইড বন্ড দ্বারা সংযুক্ত হয়। এই গঠন প্রোটিনের বেসিক ইউনিট তৈরি করে, যা আরও বৃহৎ পলিপেপটাইড বা প্রোটিনের অংশ হিসেবে গঠন করতে পারে।